การย่อยอาหาร (digestion) หมายถึง กระบวนการแปรสภาพอาหารโมเลกุลใหญ่ให้มีขนาดเล็กลง เพื่อการดูดซึมเข้าไปในเซลล์ สารอาหารจำพวก คาร์โบไฮเดรต โปรตีน ไขมัน เท่านั้น ที่ต้องผ่านกระบวนการ ย่อยอาหาร ส่วน น้ำ เกลือแร่ และวิตามิน สามารถดูดซึมเข้าไปในเซลล์ได้โดยไม่มีการเปลี่ยนแปลงใดๆ ทาง เคมี การแปรสภาพอาหารดังกล่าวนี้เกิดจากปฏิกิริยาเคมีที่อาศัยการทำงานของเอนไซม์ย่อยอาหาร (digestive enzyme) การย่อยอาหารมี 2 ขั้นตอน คือ
          1. การย่อยอาหารแบบเชิงกล (mechanical digestion) เป็นการแปรสภาพอาหารโมเลกุลใหญ่ให้มี ขนาดเล็กลงด้วยการบดเคี้ยวด้วยฟัน หรือการบีบตัวของทางเดินอาหาร
          2. การย่อยอาหารเชิงเคมี (chemical digestion) เป็นการแปรสภาพอาหารโมเลกุลใหญ่ให้มีขนาดเล็ก ลงโดยใช้เอนไซม์